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FasterDB identifier: - ()
Gene Close
Symbol
Synonyms
Description
EnsEMBL link
Chromosome - forward strand
Chromosomal location
(UCSC link)
-  (1bp)
Sequence sequence
Associated transcripts
Alternative 3' splice site (acceptor) Close
 Identifier   Position   Distance (bp)   Transcript 
Alternative 5' splice sites (donor) Close
 Identifier   Position   Distance (bp)   Transcript 
Intron retentions Close
 Identifier   Position   Transcript 
Exon deletions Close
 Identifier   Position   Transcript 
No data
Transcription start sites Close
 Identifier   Position   Gene coordinates   Chromosomal coordinates   Transcript 
Protein prediction Close
 Transcript name   Sequence 
Polyadenylation Close
 Identifier   Position   Gene coordinates of cleavage site   Chromosomal coordinates of cleavage site   Pattern   PolyA tail   Accession number   Type 

More polyadenylation sites ...

Exon skipping Close
 Identifier   Position   Transcript 
No data
Splice site strength Close
 Identifier   Site   Exon   Strength   Alternative   Sequence 
No data
Conserved exons Close
 Gene identifier human   Position mouse  Position human 
No data
Report Close
 Exon   Number of supporting transcripts 
Splicing factors Close
 Splicing factor   Exon array   CLIP data   Exon position 
CELF1 (CUG-BP)
 
DAZAP1
 
ELAVL1 (HuR)
 
ESRP1/2 Yes
 
FUS Yes
 
HNRNPA1
 
HNRNPA2B1
 
HNRNPAB
 
HNRNPC
 
HNRNPF-H
 
HNRNPL Yes
 
HNRNPL_2
 
HNRNPM
 
HNRNPU
 
MBNL3KO/MBNL3WT/MBNL3C2C12 Yes
 
Nova/Nova1 Yes
 
PTBP1/2 Yes
 
QKI
 
RBFOX2
 
RBM4 Yes
 
SFRS3 (SRP20)
 
SFRS6 (SRP55)
 
SFRS7 (9G8)
 
SRSF1 Yes
 
SRSF2 Yes
 
SRSF5 (SRP40)
 
TIA1/TIAL1
 
TRA2A
 
TRA2B
 
YBX1
 
Expression Close
 Exon position   Tissues   Cell lines 
Exon-Intron Close
 Position   Type   Gene coordinates   Chromosomal coordinates   Length   Sequence   Features 
 5' untranslated regions  Close
No data
 3' untranslated regions  Close
No data
miRNAs Close
 Identifier    Name    Gene coordinates   Chromosomal coordinates   Prediction algorithm 
No data
Protein features Close
 Category   Feature identifier   Feature name   Exons   Start on gene   End on gene 
No data
Gene

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